Moleküldynamiksimulation für ein allelspezifisches virales Nonapeptid aus dem Influenza-Matrix-protein in der Bindungstasche eines menschlichen MHC-Klasse-I-Proteins

Nicht α-helical, sondern gestreckt ist die Konformation des antigenen Peptids in der Bindungstasche des menschlichen Haupt-Histokompatibilitätskomplex-(MHC)-Proteins HLA-A2 der Klasse I. Dies ergaben Molecular-Modeling-Studien und Moleküldynamiksimulationen an einem Komplex aus HLA-A2 und einem Nonapeptid aus dem Influenza-Matrixprotein, die auf der röntgenographisch bestimmten Struktur von HLA-A2 und dem kürzlich ermittelten HLA-A2-spezifischen Peptidbindungsmotiv basieren. Das beschriebene Modell stützt vollständig bisherige Vorstellungen bezüglich der MHC-restringierten Antigenbindung.

Journal article

Moleküldynamiksimulation für ein allelspezifisches virales Nonapeptid aus dem Influenza-Matrix-protein in der Bindungstasche eines menschlichen MHC-Klasse-I-Proteins, Angewandte Chemie 1992 104 (7), 928-931